Erza et Gérald se battent contre Midnight, le plus puissant des Oracion Seis. Pendant ce temps Lucy, Grey, Natsu et Jera tentent de stopper le nirvana qui s'approche de la guilde des Cait Shelter.

La bande de Luxus a été décimée mais le palais des chants divins menace toujours la ville et Luxus refuse d'entendre raison. L'intervention de Mistgun n'y change rien, de même que l'annonce de l'état de santé de maître Makrof son grand-père. Luxus veut faire main basse sur la guilde pour remodeler Fairy Tail à son idée.

De nouveaux membres intégrent chaque jour la guilde des magiciens. Cependant, un ancien se comporte de façon inquiétante.
L'auberge de Fairy Tail a été reconstruite ! C'est un nouveau départ pour Natsu et toute la guilde. De nouveaux magiciens arrivent en masse, les événements se succèdent et tout le monde veut une interview des héros. Mais un membre de longue date de la guilde se comporte de façon inquiétante ! Une tempête de violence sans précédent s'abat sur Fairy Tail...

La battle of Fairy Tail fait rage et ne se présente pas sous le meilleur jour pour les membres fidèles au Maître Makarof. Cependant, la colère de Natsu pourrait bien modifier la donne et conduire à un renversement de situation. En attendant, l'orgueil de Luxus conduit certains membres à montrer leur puissance et à prouver leur fidélité à la guilde. Mais d'autres se révèlent peu fiables.

La révolte de Luxus est terminée et la parade peut avoir lieu. Mais à peine la fête des moissons terminée, de nouvelles aventures attendent les magiciens : Lucy découvre qu'elle est plus attachée à son père qu'elle ne le croyait et des guildes clandestines puissantes font parler d'elles.

Les Oracion Seis ont enlevé Wendy, qui est détentrice d'un grand pouvoir de guérison. Brain et les siens veulent ressusciter un homme capable de retrouver le Nirvana. Mais Ezra est terrassée par le venin d'un cobra et ses coéquipiers ont eux aussi besoin de Wendy...

Lucy affronte la terrible Angel, et Brain prend le contrôle du nirvana. Natsu et ses compagnons semblent être le dernier espoir pour empêcher le monde de sombrer dans les ténèbres.

Le combat contre Zero, le maître des Oracion Seis, fait rage et les membres de l'Alliance des guildes doivent unifier leurs forces pour parvenir à la victoire. Cependant, les forces du Conseil de la magie font arrêter Hot-Eye et Gerald pour qu'ils répondent de leurs actes devant la justice.

Natsu, Wendy, Happy et Carla découvrent que la guilde de Fairy Tail où ils ont atterri n'est pas la leur mais son équivalent dans le monde d'Edolas. Un monde où la magie est strictement limitée et où les guildes de magiciens ont été pourchassées par l'armée royale.

Wendy découvre que le roi d'Edolas a l'intention d'offrir à son royaume la magie éternelle, en lançant un cristal géant contre Extalia.
Natsu, Lucy, Wendy, Happy et Carla ont découvert la vraie nature du monde d’Edolas. Les exceed ont fait emprisonner nos deux chasseurs de dragons afin de leur voler leurs pouvoirs magiques. Mais c’est sans compter sur l’aide d’Happy et Carla qui réussissent à sauver in extremis Lucy qui était sur le point de se faire exécuter par Erza Knightwalker. Pourchasser par les soldats de la reine, nos héros se retrouvent encerclésà

L’épreuve d’accessibilité au rang de mage de classe S se déroule sur l’île sacrée de Fairy Tail. Les candidats doivent faire face à de multiples défis pour atteindre le rang de mage de classe S. La première épreuve vient de se terminer et déjà, certains sont hors course. Natsu a découvert que la victoire n’était pas forcément la meilleure façon de remporter un duel, et Elfman a affronté sa sœur avec succès même s’il n’en est pas fier... La seconde épreuve met les candidats encore en lice face à la véritable nature de l’île. Mais l’arrivée d’un mage inconnu et des membres de la guilde clandestine de Grimoire Heart remet tout en question. Face à l’adversité, l’épreuve est suspendue !

Lucy, Ezra, Jubia et Wendy se sont éclipsées de la fête donnée au palais royal en clôture du Grand Tournoi de la magie pour faire du tourisme dans la capitale. Elles tombent sur une bande de voyous qui se prétend de leur guilde et leur donnent une correction. Impressionné, leur jeune guide leur demande de trouver qui a agressé son père, un membre de la garde royale. Elles reviennent donc discrètement au palais pour enquêter. Et découvrent alors que le roi a été remplacé par un imposteur ?!

L’île sacrée de Fairy Tail devient le théâtre de combats opposant les membres de Fairy Tail à ceux de la guilde clandestine des Grimoire Heart. Maître Makarof tente de s’opposer à l’arriver de ces intrus mais il est terrassé par Hades qui n’est autre que le second maître de Fairy Tail, son prédécesseur. Les Grimoire Heart recherchent Zeleph, le légendaire magicien noir dont le seul souvenir fait trembler le monde entier. Ils veulent faire de lui le roi d’un monde magique débarrassé des humains normaux. Natsu est bien décidé à contrecarrer leurs plans mais pourra-t-il résister à la magie oubliée qu’utilisent les Sept Frères du Purgatoire ?

Pendant que Kanna rejoint la tombe de Mavis, le premier Maître de Fairy Tail, les autres membres de la guilde tentent de se regrouper. C'est à cet instant que Bluenote, le bras droit d'Hades, intervient dans le combat et fait part de ses véritables intentions ! Pour Natsu et ses compagnons les choses se présentent malà Le retour de Fried, Bixrow et Gildarts redonnent espoir aux fées pour un moment. Les membres de la guilde sont alors loin de se douter que le pire reste à venirà

Grey affronte Ultia, la fille de son maître Oul. Le combat fait d’autant plus rage qu’Ultia voit en Grey le disciple d’une mère qui, à ses yeux, l’a abandonnée. Pendant ce temps, Jubia poursuit Meldy pour lui reprendre Zeleph devenu l’objet de toutes les convoitises des Grimoire Heart. L’affrontement entre Fairy Tail et la redoutable guilde clandestine semble s’approcher de son dénouement... Encore faudra-t-il que Natsu et ses compagnons sortent victorieux du combat contre Hades qui s’annonce !

Natsu et ses compagnons sont parvenus à vaincre Hades ! Les Grimoire Heart n'ont d'autre choix que de quitter l'île de Tenrô ! Les participants à l'épreuve de sélection des mages de classe S se retrouvent et peuvent enfin goûter à un repos mérité. Mais alors que certains secrets sont révélés et qu'une terrible nouvelle leur est annoncée, Zeleph refait son apparition et prédit un avenir funeste au monde entier...

Le retour de Natsu et de ses compagnons de l’île de Tenrô est maintenant connu dans tout le royaume ! Mais Natsu et les autres découvrent qu’en leur absence, le monde a continué de tourner et que, contrairement à eux, les autres membres de la guilde ont progresséà Ils apprennent aussi que leur chère guilde est connue pour être la plus mauvaise de Fiore ! Pour rendre sa place de meilleure guilde du royaume à Fairy Tail, ils vont devoir trouver une solution pour devenir plus forts rapidement afin de rattraper les sept années perdues dans la Sphère des Féesà

Les sélections passées, le tournoi va pouvoir commencer ! L’équipe de Fairy Tail se prépare bien décidée à remonter dans le classement et à retrouver les agresseurs de Wendy et Carla ! La présentation des équipes réserve bien des surprises à Natsu et ses coéquipiers mais aussi à la guilde tout entière ! Bientôt, les épreuves commencent et il s’avère très vite que certains ne sont pas là tant pour gagner que pour se venger des Fées et qu’ils sont prêts à tout pour ça ! Le tournoi promet d’être dur pour nos amis, surtout sans le soutien du public !

La première journée du Tournoi se termine sur un bilan catastrophique pour Fairy Tail : les équipes de la guilde sont les deux dernières du classement ! La deuxième journée commence elle aussi plutôt mal, mais tout n'est pas perdu et la phase de combat se révèle pleine de surprises pour nos héros et pour les autres guildes aussi. Les favoris ne sont pas toujours les vainqueursà Parallèlement au tournoi, des complots sont partiellement révélésà

Natsu provoque le maître des Saber Tooth. La tension est à son comble dans l’auberge de la plus forte guilde du royaume. Il faut l’intervention de la propre fille du maître pour ramener notre héros à la raison. Si certains membres des Saber Tooth sont impressionnés, d’autres ne sont pas prêts à oublier l’affront fait à leur guildeà Le tournoi se poursuit malgré tout, les équipes de Fairy Tail remontent petit à petit dans le classement et dans l’estime des spectateurs, mais les sombres desseins des uns et des autres se dévoilent peu à peuà