Quand la proie devient chasseur...Elles se fondent dans la foule pour mieux se nourrir de chair humaine.Elles ressemblent aux hommes, mais leur existence est bien différente...Elles sont appelées ªgoulesº.Le CCG, une organisation gouvernementale chargée d'étudier et de combattre les goules, met sur pied un nouveau groupe pour répondre aux exigences de sa mission. Cette unité est exclusivement composée de sujets expérimentaux...Leur nom, les ªQuinckesº.Ce groupe atypique a pour mentor un jeune inspecteur de première classe, Haise Sasaki. Ensemble, ils seront vite happés par l'immense métropole de Tokyo, dont les méandres cachent parfois des visages familiers...Suite directe de Tokyo Ghoul, Tokyo Ghoul : Re témoigne de l'audace permanente de son auteur. Non content, dans son premier cycle, de nous faire découvrir son Tokyo fantastique par les yeux des goules, Ishida renverse complètement ce principe dans :Re en prenant cette fois le point de vue des policiers chasseurs de goules ! Qui sont les méchants ?

Tandis que le CCG continue de surveiller les mouvements d'Aogiri, un groupe de goules qui ne cesse de gagner en puissance, les Quinckes débutent leur enquête sur la goule "Nutcracker".
Mais, à l'occasion d'un arrêt dans un café inconnu, Haise se trouve confronté aux ombres d'un passé oublié.
Aurait-il trouvé une "clé" dans l'arôme de quelques graines torréfiées ?

Pour mettre un terme aux "enchères" humaines des goules, le CCG lance une vaste opération de nettoyage, baptisée "Clôture des enchères". Le groupe "Quinckes" mené par Haise Sasaki participe à cette opération dans l'espoir de mettre la main sur sa propre cible, la goule "Nutcracker".
Mais la silhouette tourmentée d'un être familier s'approche d'eux, dans l'ombre.La nouvelle "Chouette".
Lorsqu'il pose le regard sur cette ombre torturée surgie des abysses de son passé, Haise entend la "voix" résonner en lui...

Six mois ont passé depuis l'opération ªClôture des enchèresº.Pour sortir Shu Tsukiyama des affres de son purgatoire sans fin, Kanae von Rosewald et la famille Tsukiyama capturent des humains qu'ils lui jettent en pâture. Voyant que ces efforts ne suffisent pas à sauver son maître, Kanae décide de passer à l'action, seul. Ou presque, car Chie Hori, une jeune photographe, va l'aider à accomplir sa tâche.De leur côté, les Qs et Haise, tous promus après leur dernier succès, sont chargés d'une nouvelle mission : les ªRosesº.Ces destins se croiseront bientôt autour du seul homme qui les réunit tous, ªKen Kanekiº...

L'opération contre les ªRosesº bat son plein. Le CCG jette ses meilleurs éléments dans la bataille tandis que l'inspecteur Haise Sasaki rassemble peu à peu les fragments épars de ses vingt dernières années de souvenirs perdus.Les doutes se heurtent à la vérité, dessinant un début de silhouette dans un tourbillon chaotique.Kanae tente de se rapprocher d'ªAogiriº afin d'éliminer chacun des Qs, par fidélité pour son maître Shu Tsukiyama.La famille de ce dernier n'a jamais connu de situation aussi critique. Les filets se resserrent autour du clan Tsukiyama.Un nouveau paysage est en passe de prendre forme, éclairé par un unique œil écarlate...

L'opération d'extermination du clan Tsukiyama laisse de nombreuses victimes dans son sillage. Attirée par l'odeur du sang, la Chouette à l'œil écarlate s'invite à la fête.Les gouttes d'un amour secret commencent à perler à travers le regard décousu d'un être torturé.Des gouttes qui tombent à la suite de leur source pour mouiller une terre qu'elles n'irrigueront pas. La volonté qui les a faits naître, dénuée de but, ne peut que s'évaporer avec elles.Dans les ténèbres qui fondent sur Tokyo, deux lumières s'allument, écarlates.Deux yeux figés dans un terrible face-à-face...

Pour résister à la montée en puissance de goules qui se structurent en groupes toujours plus organisés, le CCG lance le ôprojet Quinckesö afin de former des inspecteurs qui dépassent en efficacité le célèbre Kisho Arima. Les quatre Quinckes et leur mentor Sasaki sont d’abord rejetés par leurs collègues, mais ils prouvent leur valeur lors de l’opération d’extermination du clan Tsukiyama, qui fait de nombreuses victimes dans les deux camps. Le CCG, qui compte à présent détruire ôAogiriö, découvre que le quartier général de cette organisation se trouve sur l’île de Rushima. À l’occasion de la sortie de son dernier livre, Le Roi Bileygr, la romancière Sen Takatsuki annonce publiquement qu’elle est une goule. Le fossé commence alors à se creuser entre les humains, les goules et le CCG autour de la question du supposé chef d’Aogiri, le ôRoi à l’œil écarlateö. Haise Sasaki, de garde à la Cochlée, décide d’attaquer la prison pour libérer Hinami. Alors qu’il s’apprête à s’enfuir avec elle, il se retrouve face à l’inspecteur Kisho Arima armé de la ôChouetteö, un quinque de niveau SSS. Le combat commence, mais Haise est incapable de résister à son adversaire. Il se plonge alors dans les souvenirs de son ami Hide pour retrouver la force de vivreà

« Tu es un inspecteur ! » Un cri résonne sur l'île de Rushima où les victimes s'accumulent, engloutissant le repaire d'Aogiri sous leur nombre. Le groupe Suzuya se heurte à la rancœur d'un étrange duo de jumelles, sous le regard d'un médecin manipulateur.La dernière goule de Chi Shé brûle d'affronter son vieil ennemi.Le groupe Qs d'Urie, parti à la recherche de Mutsuki, se retrouve face à un terrible spectacle.Le CCG et les goules, deux mondes que tout oppose, entrent en collision. Et commencent à s'entremêler...

"Ce que je déteste, c'est de ne rien pouvoir faire. "Les humains de Tokyo continuent de se transformer en goules.Afin de couper la source du poison, le CCG et les goules unissent leurs forces en surface, tandis que Ken et Ayato s'enfoncent dans les souterrains du 24e. Jusqu'à tomber sur un obstacle : Nimura Furuta.Que désire Ken, lui qui fut le vecteur originel du mal dans ce monde ? Quel futur attend Tokyo et ses goules ?

Six mois ont passé depuis l'opération d'extermination du clan Tsukiyama. Le CCG se prépare à frapper l'organisation ªAogiriº et son chef, le ªRoi à l'œil écarlateº. Le Centre compte envoyer la majeure partie de ses forces sur Rushima, l'île où se trouve le repaire ennemi, tandis que quelques hommes resteront en protection, notamment de la ªCochléeº. Au même moment, Sen Takatsuki, la célèbre romancière qui vient de publier ªLe Roi Bileygrº, annonce lors d'une conférence de presse qu'elle est une goule et que son dernier ouvrage est destiné à ses semblables. L'ouvrage s'attaque indirectement aux structures du pouvoir en place et sème lentement le doute au sein de la population. Haise Sasaki, celui qui n'avait pas de nom, commence à ouvrir certaines portes au milieu de hurlements stridents. Il a un ªultime travailº à accomplir...

« Un monde où humains et goules puissent se comprendre. »Ken est devenu le nouveau Roi à l'œil écarlate. Héritier de la volonté de son prédécesseur, sa mémoire à présent retrouvée, il décide de rejoindre le Café :re.Dans ce lieu où flottent les arômes nostalgiques des graines torréfiées, les compagnons d'autrefois accompagnés de nombreuses goules se pressent autour de leur nouveau roi.Il est ici pour une raison précise.Il veut donner aux goules et aux humains une chance de se comprendre. Pour cela, il fonde un nouveau groupe de combattants, les Chèvres Noires, et lui donne pour but de forcer le CCG à discuter.Son objectif est simple : détruire la coquille de ce monde...

ªJe vous en supplie, Sensei! Je ne peux pas vivre sans vous!ºLes goules aux masques de Pierrots lancent des attaques simultanées contre les antennes du CCG. Nimura Furuta, qui manipule les Pierrots dans l'ombre, soumet le Centre à sa volonté. Les Qs, formés par Haise Sasaki, ne parviennent pas à rester de marbre face aux actions des Chèvres noires dirigées par Ken Kaneki. Derrière sa volonté de révolutionner le rapport qu'entretiennent humains et goules, quel véritable objectif le Roi à l'œil écarlate cherche-t-il à atteindre?

Au plus profond du 24e, là où règne la goule à l’œil écarlate. »

Kichimura Washu, le nouveau directeur du CCG, veut exterminer l'ensemble des goules de Tokyo afin de libérer la ville de leur présence. Il met donc sur pied un nouveau groupe de combattants composé d'enfants, les ôOggaiö.

Ces ôenfants en noirsö, qui sont en réalité des Qs améliorés, se mettent en chasse avec une stupéfiante efficacité.

Face à cette répression toujours plus violente, les ôChèvres Noiresö décident d'abandonner le Café :re.

Cependant, à l'instant même où Ken Kaneki s'apprête à quitter le café, un tenace poursuivant se présente à la porte de l'établissement.

L'avenir des goules passe par le 24e arrondissement de Tokyo. Un monde souterrain et inconnu.

Un monde où depuis des générations, subsiste la légende d'un mystérieux ôRoi à l’œil écarlateö.

« L'ange de la mort entre en scène ! »Sous Tokyo se cache le 24e arrondissement, bâti par la « Goule à l'œil écarlate ». Dans cette terre encore sauvage où les Chèvres noires ont établi leur repaire, les derniers cris de joie célébrant l'union de Ken et Toka ont fini de résonner.Plus haut, en surface, le nouveau directeur Kichimura Washu s'apprête à exécuter Yoriko Kuroiwa au motif d'une infraction au Code de gestion des goules.Le funeste jour est fixé au 23 avril.Le Oggai qui s'est introduit dans le 24e arrondissement commence à menacer l'existence des Chèvres noires. Il est l'incarnation d'une mort double, symbole de son groupe.L'ange de la mort, ancien porteur du numéro 13, a touché terre tandis que des larmes noires coulent sur les joues de Ken Kaneki. Elles sont le cruel marqueur du temps qu'il lui reste...

« Il est là, Ken. »Comme l'avait prévu Furuta, Ken se transforme en « dragon » après avoir absorbé une grande quantité d'Oggai, puis fonce vers la surface.Dans Tokyo, les cris de désespoir s'élèvent à mesure que le carnage s'étend. La capitale connaît une panique sans précédent.La voix d'un vieil ami résonne alors.Afin de récupérer Tokyo et Ken Kaneki, le CCG et les goules prennent une décision commune.Tous ont le regard tourné vers l'horizon de ce « monde absurde » où semble poindre une lueur...

ªC'est parce que tu les as tous dévorés que je suis ici.ºLes goules et le CCG décident de se tendre la main afin de sauver Ken et Tokyo.Tandis que les habitants de la capitale unissent leurs forces vives, deux personnes remontent la piste du ªcorps initialº perdu dans la gigantesque créature qui a englouti le cœur du 23e arrondissement.Tooru Mutsuki, qui court derrière l'ombre de Haise Sasaki, et Toka Kirishima, qui refuse de laisser Ken Kaneki sombrer.Une confrontation qui poussera les Qs à trouver un sens à leur existence.Pendant ce temps-là, tout au fond du cerveau de Ken, la faim incarnée en femme se manifeste à nouveau...